Sejak diperkenalkan pada 1970-an, analisis mikrob telah mengalami pembangunan dan penambahbaikan yang berterusan. Pada mulanya, ia digunakan terutamanya untuk pengesanan sampel alam sekitar, dan kemudiannya secara beransur-ansur berkembang ke bidang perubatan, pertanian, biokejuruteraan, dan lain-lain. Dengan kemajuan berterusan bioteknologi, analisis mikrob telah terus berinovasi dan diperbaiki, menjadi kaedah analisis yang penting .
